本研究根据截形苜蓿(Medicagotruncatula)根部的几丁质酶基因保守序列(GenBank登录号:AF167328)设计引物,通过RT-PCR直接扩增的方法得到了紫花苜蓿(MedicagoSativaL.)根部几丁质酶基因保守序列.根据得到的保守序列设计3'端和5'端特异引物,分别从3'端和5'端扩增延长该片段,最后通过序列拼接获得紫花苜蓿根部一种几丁质酶基因的全长cDNA序列,命名为MsChiⅣ(GenBank登录号:FJ487629).MsChiⅣ基因全长为1025bp,开放*阅读框全长为849bp,编码282个氨基*,分子量为30.5kD,预测等电点为4.66,其结构包括信号肽、几丁质结合区、糖苷水解酶区,为Ⅳ类几丁质酶,属于几丁质酶第19家族,在氨基*水平上与截形苜蓿几丁质酶蛋白同源*最高,达到98%.蛋白结构分析表明该基因编码蛋白为非跨膜蛋白,存在于细胞质中.

第2篇：人溶菌酶基因cDNA的克隆和序列分析

根据GenBank中的人溶菌酶(hLYZ)mRNA序列设计引物,以人胎盘组织总RNA为模板,通过RT-PCR方法扩增出长度为0.85kb的hLYZcDNA序列,经过序列测定表明所克隆的片段与已发表的hLYZcDNA序列的同源*为99%.推导的氨基*序列经blastp分析与人溶菌酶蛋白质前体的同源*为97%,成熟肽的同源*为99%,为进一步构建人溶菌酶基因乳腺特异*表达载体奠定了基础.

第3篇：白花柽柳质膜水孔蛋白基因克隆及序列分析

上海水磨工作室植物水孔蛋白在植物体内形成水选择*运输通道,在植物种子萌发、细胞伸长、气孔运动、受精等过程中调节水分的快速跨膜运输.有的水孔蛋白还在干旱胁迫应答中起重要作用.本文根据白花柽柳的PEG6000胁迫处理构建的SSH消减文库的水孔蛋白基因表达序列标签(EST),设计基因特异*引物进行5′RACE,克隆出一个1043bp的核苷*序列.应用生物信息学软件进行分析,预测该序列编码287个氨基*,具有6个跨膜区,有MIP家族信号序列SGXHXNPAVT,高等植物PIP高度保守序列GGGANXXXXGY和TGI/TNPARSL/FGAAI/VI/VF/YN,这是质膜水孔蛋白基因的典型的结构特征.经NCBI比对,与Arabidopsisthaliana(MIP-C),同源*达到95%,预测该蛋白的相对分子量是30.9KD,理论等电点是8.84.

上海水磨工作室杨传平,王玉成,YANGChuan-Ping,WANGYu-Cheng(东北林业大学林学院,哈尔滨,150040)

上海水磨工作室张道远,ZHANGDao-Yuan(*科学院新疆生态与地理研究所,乌鲁木齐,830011)?